Il X-Men i fumetti ne presentano molti storie e squadre diverse lavorare insieme per proteggere il mondo da varie minacce. Tuttavia, dopo decenni di pubblicazione, è quasi garantito che i problemi che mettono in discussione la continuità del franchise emergano. Lo stesso può valere per il X-Men film usciti dal 2000 al 2020, in particolare con una scena particolare del 2006 X-Men: L'ultima resistenza.
Nel film, il Professor X (interpretato da Patrick Stewart) è costretto ad affrontare il suo errore più grave nella forma di Jean Gray (interpretata da Famke Janssen) e la sua trasformazione nella Dark Phoenix. Dopo anni passati a tenere a bada l'insormontabile potere psichico di Jean, si sono manifestati come una personalità oscura che rispecchiava la sua controparte comica. Una grande differenza tra i due si verifica a metà The Last Stand , tuttavia: Jean uccide il Professore nella sua casa d'infanzia. Il pubblico pensava che questo avrebbe segnato la fine per il Professor X, ma la sua storia non è finita qui.
Di tutti gli insoliti colpi di scena che il X-Men film offerti, il più misterioso è stato nascosto in una scena dopo i titoli di coda in The Last Stand , che ha rivelato che il Professore è sopravvissuto trasferendo la sua coscienza nella mente di un uomo in coma. La dottoressa Moira MacTaggert (interpretata da Olivia Williams) ha scoperto il segreto della sopravvivenza del Professor X. Mentre una frase precedente nel film spiegava l'idea, il mistero del ritorno di Xavier non viene mai completamente spiegato o addirittura menzionato nei film successivi.
Il pubblico non avrebbe più rivisto Charles Xavier fino al 2013 il ghiottone in una scena dopo i titoli di coda. In questa sequenza, Logan si trova faccia a faccia con il Professore e gli chiede come è sopravvissuto. Charles ha risposto con un callback al primo film degli X-Men, affermando: '[Sei] non l'unico con doni.' Quella sola affermazione sarebbe stata l'unica spiegazione per la sua risurrezione per diversi anni.
Prima che Stewart riprendesse il suo ruolo di Professore un'ultima volta in Logan , è apparso nel 2014 X-Men: Giorni di un futuro passato , che ha anche mostrato il ritorno di molti membri del cast classico che hanno combattuto in un futuro non così lontano contro le Sentinelle. Molti fan hanno ipotizzato che il Professor X abbia spiegato il suo ritorno agli altri fuori dallo schermo ad un certo punto poiché nessuno del cast ha messo in dubbio il suo ritorno da una morte quasi certa.
Mentre molte teorie stanno ancora fluttuando nel fandom, alla ricerca di modi alternativi per il ritorno di Charles, la spiegazione principale è che il Professore sembrava se stesso nonostante avesse un corpo diverso perché l'uomo in coma era suo fratello gemello. Prima della sua morte, Xavier aveva trasferito la sua coscienza in quest'altro corpo. Le sue capacità fisiche rimangono le stesse perché, anche se aveva un nuovo corpo, i suoi muscoli delle gambe erano probabilmente pesantemente atrofizzati. Sebbene questa spiegazione non sia la più ermetica dal punto di vista della trama, una battuta che menziona il processo in precedenza nel film sembra supportare la teoria.
Purtroppo, uno dei più grandi misteri del X-Men film – quello della resurrezione del Professor X dopo essere stato assassinato da Dark Phoenix – non hanno mai avuto la grande spiegazione che meritava. Invece, è stato dato per scontato che il pubblico non avrebbe guardato troppo a fondo il mistero. Ora che i Marvel Studios hanno i diritti, c'è speranza che la loro prossima uscita sul grande schermo avrà molti meno thread di trama sciolti.
