Card Captor Sakura i fan sono ben consapevoli delle differenze tra il finale del manga e quello dell'anime, che, sebbene non drastiche, erano comunque significative. Non è raro che una serie manga abbia un adattamento che devia anche dal materiale di partenza.
Indipendentemente dai motivi esatti, la differenza più notevole tra il Card Captor Sakura i finali di manga e anime sono il modo in cui vengono rappresentate le relazioni tra i personaggi e la sequenza di determinati eventi. Inoltre, anche lo sviluppo di alcuni dei personaggi secondari è stato escluso dall'adattamento dell'anime.
Nell'anime, Syaoran ammette i suoi sentimenti per Sakura subito dopo la battaglia finale con Eriol. Lui e Sakura sono imbarazzati l'uno con l'altra finché sua madre non lo richiama a Hong Kong per... adempiere agli altri suoi doveri . Dopo che Sakura scopre che se ne sta andando, piange nella sua stanza, dove crea inavvertitamente la Carta della Speranza. Incontra Syaoran all'aeroporto e lui le dà l'orso che ha creato all'inizio della stagione. Non sarebbe stato fino al secondo film che Sakura sarebbe stata in grado di restituire i sentimenti di Syaoran quando pensava che la Carta del Nulla avesse rimosso i suoi sentimenti per lei.
Nel manga, passa del tempo prima che Syaoran confessi i suoi sentimenti a Sakura nel Penguin Park, dove le dice anche che deve tornare a Hong Kong. Sakura chiede consiglio ai suoi amici e fa di lui un orso prima di correre per incontrare Syaoran prima che il suo autobus parta. Insegue il suo autobus mentre si allontana ed è in grado di dargli l'orso e confessare i suoi sentimenti. La storia riprende poi due anni dopo, quando Syaoran torna a vivere in Giappone, e lui e Sakura riprendono la loro relazione. Qui è dove Cancella l'arco delle carte riprende con tutti quelli che iniziano la scuola media insieme e Akiho si trasferisce a Tomoeda.
La relazione tra Syaoran e Sakura che viene ulteriormente esplorata non è l'unico cambiamento apportato. Dopo la sua lotta con Sakura, Eriol dà a suo padre metà del suo potere in modo che Sakura possa essere più potente. Questo perché sia Fujitaka che Eriol sono due metà dell'anima di Clow Reed. Per questo motivo, Fujitaka è ora in grado di vedere lo spirito della sua defunta moglie Nadeshiko, proprio come suo figlio Touya. L'anime non spiega nulla di quella situazione. Inoltre, Eriol e Kaho Mizuki iniziano una relazione romantica nel manga che non è riconosciuta nell'anime. Inoltre, Rika si fidanza con Terada e anche Chiharu e Yamazaki continuano la loro relazione insieme.
Touya e Yukito sono ancora amici, e Touya e Yue sono amichevoli l'uno con l'altro. Le abilità magiche di Touya stanno lentamente tornando a lui dopo averle date a Yue quando Sakura non era abbastanza forte da sostenere la sua magia, e ha iniziato a sviluppare nuove abilità in cui non entra. Yukito è anche a conoscenza della sua altra identità come Yue. È implicito che Touya e Yukito siano fidanzati.
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Molte delle relazioni nel manga sono più approfondite, offrendo uno sguardo esteso su come continuano a crescere e prosperare. Se i fan del Card Captor Sakura gli anime erano curiosi di dare un'occhiata al manga, saperne di più sulle relazioni in erba è sicuramente una solida ragione.
